：变成了灰原哀，知道牧远和姐姐如果直到了她的情况，一定会竭尽全力的保护她，所以为了保护牧远和姐姐，决定听从阿笠博士的劝告，向两人隐藏自己的身份，并计划着用自己的方式保护两人。
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柯南：听过阿笠博士的简单介绍，推理出了牧远和灰原哀都是组织的人，但并不是敌人，并由于灰原哀不愿意配合他对抗黑衣组织，从而决定继续留在小兰家，通过毛利侦探事务所的信息优势，寻找其他和组织有关的线索。
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毛利兰：知晓了柯南就是变小后的工藤新一，不想新一再像以前一样，做什么危险的事情都瞒着她，从而选择了假装不知情，准备在柯南再要做危险的事情时，保护他或制止他的行为。（认为牧远是一个善良而勇敢的人，对牧远和灰原哀的身世很是同情，在牧远的话和工藤新一遭遇的影响下，决心要成为真正能战胜邪恶的——警察。）
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贝尔摩德：用魏玫寺的身份收养了牧远，渐渐沉溺于母亲的身份中。担心牧远抓捕琴酒的大动作会出问题，选择回到曰本潜伏进迫田家（家主是警视厅的一位高层，警视监。）暗中观察和保护。立场飘忽不定，
利用牧远对琴酒动手，琴酒无暇关注实验室和宫野志保的机会，给宫野志保喂下了宫野艾莲娜研制的毒药，但由于毛利兰的出现而未能得到宫野志保的尸体，进入组织实验室彻底销毁药物研究资料，暂时认为宫野志保已死。
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琴酒：给工藤新一灌下aptx-4869后，由于被带着防毒面具的武道家假扮交易对象埋伏，将注意力放在了自己身份是否暴露，组织是否会派出杀手清除自己上，暂时没有注意到工藤新一的尸体并没有被警方发现。
经过贝尔摩德的提示，将注意力放在了突然失踪的雪莉身上，认为在自己被埋伏和被救的两拨人中，至少有一波和雪莉有关，遂命令伏特加炸毁了实验室，让二泉寺成为组织当前唯一可以让药物研究继续的合适地点，同时防止研究资料外泄。
因为交易任务失败，错失研究用地；以及雪莉失踪的事情，引起了组织二把手朗姆的注意。
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朗姆：将身份尚未泄露给曰本警方的信息告诉了琴酒，并推测出对琴酒动手的人，一定就在组织内部，遂决定亲自出手，提示要执行一个一箭双凋的计划，命令琴酒等待他的到来，配合他的下一步行动。（朗姆的注意力放在了宫野明美的身上，并怀疑通过组织测谎仪的牧远，是否真的不会撒谎。）
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安室透：被宫野明美委托寻找妹妹，发现宫野志保当天并没有返回实验室，随后收到了朗姆索要宫野明美情报的短信，结合从牧远处得到的“琴酒被一位面具斗篷人救走了”的消息，推断
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